MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methylomicrobium alcaliphilum chromosome

Total Repeats: 73443

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016112	CAT	2	6	62918	62923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403439
1002	NC_016112	ATG	2	6	63012	63017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403439
1003	NC_016112	TCA	2	6	63024	63029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403439
1004	NC_016112	AAAG	2	8	63030	63037	75 %	0 %	25 %	0 %	357403439
1005	NC_016112	ATG	2	6	63040	63045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403439
1006	NC_016112	GTT	2	6	63052	63057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403439
1007	NC_016112	CAAG	2	8	63232	63239	50 %	0 %	25 %	25 %	357403440
1008	NC_016112	A	6	6	63299	63304	100 %	0 %	0 %	0 %	357403440
1009	NC_016112	TCG	2	6	63363	63368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403440
1010	NC_016112	ATT	2	6	63392	63397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403440
1011	NC_016112	GCC	2	6	63452	63457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403440
1012	NC_016112	ATT	2	6	63459	63464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403440
1013	NC_016112	AAAGCG	2	12	63527	63538	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	357403440
1014	NC_016112	CCG	2	6	63562	63567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403440
1015	NC_016112	GAA	2	6	63587	63592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403440
1016	NC_016112	CCG	2	6	63597	63602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403440
1017	NC_016112	GC	3	6	63664	63669	0 %	0 %	50 %	50 %	357403440
1018	NC_016112	ATCG	2	8	63685	63692	25 %	25 %	25 %	25 %	357403440
1019	NC_016112	TCA	2	6	63735	63740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403440
1020	NC_016112	CGC	2	6	63745	63750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403440
1021	NC_016112	GGC	2	6	63768	63773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403440
1022	NC_016112	GCC	2	6	63789	63794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403440
1023	NC_016112	CGA	2	6	63820	63825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403440
1024	NC_016112	A	6	6	63825	63830	100 %	0 %	0 %	0 %	357403440
1025	NC_016112	TGA	2	6	63891	63896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403440
1026	NC_016112	ATCG	2	8	63911	63918	25 %	25 %	25 %	25 %	357403440
1027	NC_016112	CGG	2	6	63948	63953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403440
1028	NC_016112	GTCA	2	8	64010	64017	25 %	25 %	25 %	25 %	357403440
1029	NC_016112	GA	3	6	64033	64038	50 %	0 %	50 %	0 %	357403440
1030	NC_016112	CGC	2	6	64085	64090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403440
1031	NC_016112	ATCTCG	2	12	64161	64172	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	357403440
1032	NC_016112	CCG	2	6	64209	64214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403440
1033	NC_016112	TGC	2	6	64245	64250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403440
1034	NC_016112	GC	3	6	64280	64285	0 %	0 %	50 %	50 %	357403440
1035	NC_016112	GCG	2	6	64290	64295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403440
1036	NC_016112	AAC	2	6	64394	64399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403440
1037	NC_016112	GAG	2	6	64445	64450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357403440
1038	NC_016112	A	7	7	64539	64545	100 %	0 %	0 %	0 %	357403440
1039	NC_016112	CGA	2	6	64546	64551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403440
1040	NC_016112	ACG	2	6	64599	64604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403440
1041	NC_016112	GCC	2	6	64742	64747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403440
1042	NC_016112	CGA	2	6	64774	64779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403440
1043	NC_016112	AT	3	6	64780	64785	50 %	50 %	0 %	0 %	357403440
1044	NC_016112	GCT	2	6	64798	64803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403440
1045	NC_016112	GGC	2	6	64906	64911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403440
1046	NC_016112	A	7	7	64915	64921	100 %	0 %	0 %	0 %	357403440
1047	NC_016112	CGG	2	6	64932	64937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403440
1048	NC_016112	TTTTG	2	10	64943	64952	0 %	80 %	20 %	0 %	357403440
1049	NC_016112	CCG	2	6	64965	64970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403440
1050	NC_016112	GTC	2	6	65062	65067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403440
1051	NC_016112	TTG	2	6	65134	65139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403440
1052	NC_016112	CAAA	2	8	65197	65204	75 %	0 %	0 %	25 %	357403440
1053	NC_016112	TCG	2	6	65217	65222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403440
1054	NC_016112	GTC	2	6	65289	65294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403440
1055	NC_016112	ATC	2	6	65369	65374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403441
1056	NC_016112	ATC	2	6	65408	65413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403441
1057	NC_016112	TCA	2	6	65418	65423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403441
1058	NC_016112	TTTC	2	8	65426	65433	0 %	75 %	0 %	25 %	357403441
1059	NC_016112	GCC	2	6	65434	65439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403441
1060	NC_016112	CGC	2	6	65548	65553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403441
1061	NC_016112	AATC	2	8	65584	65591	50 %	25 %	0 %	25 %	357403441
1062	NC_016112	ATA	2	6	65598	65603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403441
1063	NC_016112	CTC	2	6	65605	65610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357403441
1064	NC_016112	A	8	8	65635	65642	100 %	0 %	0 %	0 %	357403441
1065	NC_016112	A	8	8	65741	65748	100 %	0 %	0 %	0 %	357403441
1066	NC_016112	A	6	6	65781	65786	100 %	0 %	0 %	0 %	357403441
1067	NC_016112	CAA	2	6	65842	65847	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403441
1068	NC_016112	GCG	2	6	65849	65854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403441
1069	NC_016112	GGT	2	6	65887	65892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357403441
1070	NC_016112	A	6	6	65893	65898	100 %	0 %	0 %	0 %	357403441
1071	NC_016112	TTTA	2	8	66024	66031	25 %	75 %	0 %	0 %	357403442
1072	NC_016112	A	7	7	66041	66047	100 %	0 %	0 %	0 %	357403442
1073	NC_016112	A	6	6	66072	66077	100 %	0 %	0 %	0 %	357403442
1074	NC_016112	GAC	2	6	66078	66083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403442
1075	NC_016112	GCC	2	6	66233	66238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403442
1076	NC_016112	GGT	2	6	66255	66260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357403442
1077	NC_016112	AAT	2	6	66979	66984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403443
1078	NC_016112	AAT	2	6	67039	67044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403443
1079	NC_016112	TTG	2	6	67094	67099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403443
1080	NC_016112	GT	3	6	67139	67144	0 %	50 %	50 %	0 %	357403443
1081	NC_016112	GT	3	6	67179	67184	0 %	50 %	50 %	0 %	357403443
1082	NC_016112	TAT	2	6	67314	67319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403443
1083	NC_016112	CGA	2	6	67343	67348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403443
1084	NC_016112	TA	3	6	67355	67360	50 %	50 %	0 %	0 %	357403443
1085	NC_016112	TAT	2	6	67365	67370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403443
1086	NC_016112	AAT	2	6	67380	67385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403443
1087	NC_016112	GTC	2	6	67476	67481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403443
1088	NC_016112	AT	3	6	67492	67497	50 %	50 %	0 %	0 %	357403443
1089	NC_016112	TTGGTT	2	12	67498	67509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403443
1090	NC_016112	TAGTCT	2	12	67551	67562	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	357403443
1091	NC_016112	A	8	8	67595	67602	100 %	0 %	0 %	0 %	357403443
1092	NC_016112	GAT	2	6	67665	67670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403443
1093	NC_016112	TTA	2	6	67752	67757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403443
1094	NC_016112	TTAT	2	8	67789	67796	25 %	75 %	0 %	0 %	357403443
1095	NC_016112	CTG	2	6	67799	67804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403443
1096	NC_016112	ATT	2	6	67818	67823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403443
1097	NC_016112	A	7	7	67842	67848	100 %	0 %	0 %	0 %	357403443
1098	NC_016112	CGA	2	6	67851	67856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403443
1099	NC_016112	TAT	2	6	67864	67869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403443
1100	NC_016112	TA	3	6	67886	67891	50 %	50 %	0 %	0 %	357403443
1101	NC_016112	GAA	2	6	67945	67950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403443
1102	NC_016112	ATT	2	6	68002	68007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403443
1103	NC_016112	TA	3	6	68008	68013	50 %	50 %	0 %	0 %	357403443
1104	NC_016112	AT	3	6	68021	68026	50 %	50 %	0 %	0 %	357403443
1105	NC_016112	AAT	2	6	68038	68043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403443
1106	NC_016112	TGT	2	6	68121	68126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403443
1107	NC_016112	TTAAT	2	10	68129	68138	40 %	60 %	0 %	0 %	357403443
1108	NC_016112	GCT	2	6	68167	68172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403443
1109	NC_016112	T	6	6	68193	68198	0 %	100 %	0 %	0 %	357403443
1110	NC_016112	TA	3	6	68202	68207	50 %	50 %	0 %	0 %	357403443
1111	NC_016112	GTT	2	6	68265	68270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403443
1112	NC_016112	A	7	7	68309	68315	100 %	0 %	0 %	0 %	357403443
1113	NC_016112	GAC	2	6	68350	68355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403444
1114	NC_016112	T	8	8	68371	68378	0 %	100 %	0 %	0 %	357403444
1115	NC_016112	AAAT	2	8	68425	68432	75 %	25 %	0 %	0 %	357403444
1116	NC_016112	ATG	2	6	68472	68477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403444
1117	NC_016112	AGC	2	6	68495	68500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403444
1118	NC_016112	TGA	2	6	68506	68511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403444
1119	NC_016112	TAA	2	6	68517	68522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403444
1120	NC_016112	A	6	6	68521	68526	100 %	0 %	0 %	0 %	357403444
1121	NC_016112	AGA	2	6	68542	68547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403444
1122	NC_016112	TTGC	2	8	68563	68570	0 %	50 %	25 %	25 %	357403444
1123	NC_016112	ATT	2	6	68595	68600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403444
1124	NC_016112	TAA	2	6	68611	68616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403444
1125	NC_016112	AAG	2	6	68632	68637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403444
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1375	NC_016112	A	6	6	82649	82654	100 %	0 %	0 %	0 %	357403455
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